在宇宙生物侵略者之戰中,隨著蓋特機器人的英勇奮戰,最終成功結束了這場戰爭。 自此之後的三年,曾經被擊敗的侵略者再次現身地球。不僅如此,曾是蓋特機器人開發者的早乙女博士也神秘復活了,而他正是被認為遭到流龍馬(實際上是神隼人)殺害的人。如今,早乙女博士率領著蓋特G軍團,準備徹底消滅全人類。為了應對這場危機,早已解散的蓋特小隊成員再次集合,而因涉嫌謀殺早乙女博士而被關押的龍馬也加入了他們,一同前往早乙女研究所展開反擊。