被流龍馬所殺害的蓋特機器人開發者‧早乙女博士復活並且率領蓋特飛龍軍團要來對抗蓋特小隊。本作中,以前就一直有登場的敵人「恐龍帝國」和「百鬼帝國」都未登場,反而變成從宇宙到來的未知生命體「侵略者」成為這次的敵人。