以SD比例表現的機器人跨界作品「超級機器人大戰系列」的第3作。《第2次超級機器人大戰》（下稱「第2次」）的續編、DC戰爭系列的第2作。超級機器人大戰系列首次使用路線分岐，透過玩家的選擇使故事出現分歧，而且達成特定條件更能進入隱藏關卡。連分岐在內關卡總數共62話。
發售平台為超級任天堂，資料容量比《第2次》多3倍，圖像與音響質素也得到大幅提升。戰鬥動畫中的機器人的動作變得更多樣化，也首次在戰鬥動畫內出現背景。另外《勇者萊汀》的萊汀的必殺技「ゴッドバード」更加入細小的動畫切入、《超電磁機器人 孔巴德拉V》的孔巴德拉V的合體動畫也於本作首次登場。
