先の戦争終結より3年が経った西暦2201年。地球と木星間に休戦条約が結ばれ、人類は再び一つになろうとしていた。 そんな中、ボソンジャンプを新たな交通手段として使用する計画「ヒサゴプラン」のコロニーが次々と襲撃される事件が発生する。連合宇宙軍ナデシコB艦長ホシノ・ルリ少佐は、事件調査のためターミナルコロニー「アマテラス」へ向かう。
