本作是本作超級機器人大戰系列在Game Boy Advance發售的第2作。全37話／51關。標題的「R」是指「Reversal」。
本作特徵，是不少1990年代製作的機器人動畫參戰。特別是與鋼彈、無敵鐵金剛並列常時參戰的蓋特系列，本作首次交換作OVA版參戰。
正在月面基地替新型機「Excellence（エクサランス）」進行實戰測試的主角、ラージ、ミズホ3人，突然受到不明的敵人「デュミナス」的介入，及後被連邦軍的戰艦「拉·凱拉姆」和「撫子B」所救。主角們因而與他們共同作戰，卻再次受到デュミナス的襲撃，導致Excellence的「時流エンジン」暴走。主角3人與機體回到「5年前的世界」……。
