講述的是兜甲兒和劍鐵也二人合流之後的故事，面臨永遠的敵人”地獄博士“和他的機械獸，為了保衛光子力研究所而開始了不懈的戰鬥。但是在一次戰鬥中，由於阿修羅男爵投入了大量機械獸，從空陸兩方夾擊，大魔神不支戰敗，而魔神Z更是被捕獲帶走，甲兒與此同時也失踪了，生死未卜。
一日，阿修羅男爵帶著改造後的魔神Z侵入了光子力研究所，舊傷未癒的大魔神慌忙應戰，結果大敗。就在魔神z正要痛下殺手的同時，一部巨大威猛的Super Robot出現了，強大的裝甲令魔神Z的攻擊完全無效，舉手投足之間便打敗了魔神Z，但是，接下來他的目標………………竟是光子力研究所？ ！