オリハルトと呼ばれる特殊な鉱石の発見により、技術革新が進み、人類が飛躍的な進歩を遂げた世界。人々の居住域は太陽系を超え、宇宙各地に広がっていた。また、人間の意識を転送して操縦するIマシンという人型ロボットが開発され、民間・軍事用を問わず広く利用されていた。
ある日、白鳥座アルビレオ二重連星を訪れていた惑星連盟アカデミーの学生ミクリ・マヤは、Iマシンを使ったオリハルトの採掘作業中に事故に巻き込まれ、教授たちに見捨てられて置き去りにされる。まもなく、オリハルトの民間採掘業者「エスカベイト社」と名乗る者たちに救助され、彼らの母船「ストゥルティー号」で九死に一生を得るが、自分が不正取引の容疑で指名手配されていることを知る。仕方なく社長グレイマンの誘いに応じ、エスカベイト社で働くことになる。
その後、エスカベイト社が採掘したオリハルトの中から謎の少女アリスが現れる。何者かに狙われている彼女を守りながら宇宙を駆ける中、アリスと接するエバートランサーであるイドの記憶が徐々に明らかになっていく。
