『新世紀エヴァンゲリオン』の監督である庵野秀明氏が、2016年7月29日に公開される「ゴジラシリーズ」の一つ『シン・ゴジラ』にも参加している事から企画が実現した。
著名人によるゴジラとエヴァンゲリオンが共演するイラストの提供や、グッズの販売等が行われている。
ハリウッド映画『ゴジラ キング・オブ・モンスターズ』の公開日となった2019年5月31日にはテーマパーク「ユニバーサル・スタジオ・ジャパン」にて映像アトラクション「ゴジラ対エヴァンゲリオン・ザ・リアル 4-D」が公開され、このアトラクションが本企画初の映像作品となった。