住在駿河灣的港口小鎮、以問題少年聞名的神勝平,與他的對手香月真吾進行決鬥時,遭遇了一個神秘的巨大怪物襲擊。這怪物是來自神秘宇宙人「蓋佐克(ガイゾック)」派出的殺戮機器人兵器——「機械強襲者(メカ・ブースト)」。
在襲擊過程中,勝平得知家人一直以來以「尋寶」為名在海底進行探索的真正原因。原來,勝平一家是來自蓋茲克摧毀母星比亞路(ビアル)的倖存比亞魯星人後裔。如今,蓋茲克的魔掌終於伸向地球。為了對抗蓋茲克,神家族動用了祖先留下來的三座基地,將它們合體形成要塞「帝皇比亞路(キング・ビアル)」,以及藏於各基地中的三台機械合體而成的巨大機器人「桑波特3(ザンボット3)」。
然而,桑波特3與機械強襲者的戰鬥造成日本變成一片焦土,地球人比起蓋茲克,反而更恐懼並厭惡神家族。儘管如此,神家族仍然不顧一切地與蓋茲克奮戰。在地球人開始逐漸理解他們的真心時,蓋茲克卻展開了殘酷的人間炸彈計畫,讓神家族與地球人陷入更深的恐懼與絕望。
最終決戰終於揭開序幕,戰場轉移至宇宙。神家族與蓋茲克展開激烈交鋒,但在這場戰鬥中,神家族一個接一個地犧牲。勝平終於面對蓋佐克的本體,卻震驚地得知其真實身份竟然是一台電腦,以及電腦所吐露的驚人事實。
儘管如此,勝平仍堅信自己過去的戰鬥沒有白費。在僅存的家族成員以捨身的策略掩護下,他艱難地返回地球。當他躺在自己生長的土地上的海灘上時,迎接他的,卻是那些曾經憎恨並排斥神家族的眾多地球人,向他展現出溫暖的接納與感激。