- Work新機動戰記鋼彈 W 無盡的華爾茲/新機動戦記ガンダムW Endless Waltz
- Pilotヒイロ・ユイ
在《新機動戰記鋼彈W Endless Waltz 敗者們的榮光(敗栄)》及《新機動戰記鋼彈W Frozen Teardrop(FT)》中登場的「原型零式」(プロトゼロ)被設定為EW版飛翼鋼彈零式改修前的姿態。由於基於電視版的設計,該機體具備變形為新型鳥形態的機構和盾牌等武裝,但在Katoki的設計下,翅膀內部增加了新型鳥形態用的輔助翼,進行了一些修改。這台「原型零式」廣義上也屬於「EW版」,但為了方便起見,通常僅將改修後的姿態稱為「EW版」。
在《Frozen Teardrop》中,這台原型零式被設定為基於先行開發的試作零號機設計製造的兩台機體之一。試作1號機由A.C.186年左右六位科學家之一的J博士製造,駕駛員為希洛的生父阿迪恩·羅。當時的技術尚未完成狙擊序列和雙重破壞步槍,零式系統也未達到實用階段。2號機則由卡特爾根據在溫拿家族中隱藏的零號機數據製造,並將未完成的武裝和系統提升至實用水準。加藤設計的「原型零式」即對應這台2號機。
在《敗者們的榮光》中,原型零式是根據H教授的設計圖製造的,特蘭特被零式系統吞噬而暴走的經過與電視版相同,但在與地獄死神的戰鬥中,改為由希爾妲·修拜卡駕駛的宇宙型里歐加入支援。最終,特蘭特自爆機體後,原型零式如上所述被改修,成為了EW版的飛翼鋼彈零式。