公元2087年,地球與宇宙被戰火席捲,一場新的戰爭爆發。主張「人類再生」的基格諾斯帝國(ギガノス帝国)在月球建立了軍事獨裁政權,並向地球聯邦發動世界征服戰爭,戰爭的陰影籠罩著整個太空。
在宇宙殖民地亞路卡亞,三名少年——健、萊特、達普,意外獲得了地球聯邦軍從基格諾斯帝國盜取的機甲戰士(Metal Armor)「龍騎兵」的啟動磁碟,並因機緣巧合被登錄為這台機體的正式駕駛員。
然而,他們的行動激怒了基格諾斯帝國,對方為了奪回機體,不惜動用熔岩砲摧毀殖民衛星,導致三人被迫走上反抗基格諾斯的戰鬥之路。在旅途中,他們遇見了機甲戰士的開發者——普拉托博士,以及他的子女馬約與琳達。在這場決定宇宙與地球命運的戰爭中,他們的相遇是否能夠改變局勢,帶來新的希望?