西元2055年。LBX被正式認定為全世界最頂尖的娛樂興趣之一，不僅設立了職業聯盟，在商業領域也展現出壓倒性的影響力。 就在這個時代，有兩位轉學生——瀨名新（アラタ）與星原光（ヒカル）——轉入了專門培育LBX玩家的唯一學校「神威大門綜合學園」。 新因能就讀世界唯一的LBX玩家養成學校而滿懷幹勁，卻發現這所學園規定，所有學生都必須參加利用直徑達10公里的巨大立體模型「第二戰場（セカンドワールド）」所進行的模擬戰爭——「戰爭時間（ウォータイム）」。
