故事起因於魯魯修於「Zero鎮魂曲」事件上遭遇史詩式遇刺事件，被眾人認定已經死亡後2年。
於民眾的仇恨壓迫中，魯路修在「Zero鎮魂曲」事件上遭遇史詩式遇刺事件，被眾人認定已經死亡。事實上魯路修殺死查爾斯時繼承到不完整的Code，所以在C的世界有可能重新構築肉體。C.C.也因為魯路修未完成與她的約定決定孤注一擲，請夏麗和傑瑞米亞合作把魯路修的遺體偷出來秘密進行復活。卻發現集合無意識因為魯路修的Geass影響，導致C的世界常理混亂，僅修復魯路修的肉體，精神與記憶完全喪失。
於兩年後，娜娜莉·VI·不列顛尼亞於採訪集住區時遭到神秘的KMF襲擊與一同護衛的Zero(朱雀)一起被抓了。 而C.C.在這2年期間不斷遊歷世界各地……尋找關於Code 系統古代遺跡，其目的是找到一個健全的遺跡，但事實上大部份古代遺跡已因魯路修命令下幾乎被毀壞殆盡，C.C.為了讓擁有不完全Code的魯路修復活，帶著空有肉身卻失去靈魂的魯路修經歷各種生死難關，因緣際會下巧遇卡蓮一行人，抵達了Geass分支教團管理的遺跡，成功將魯路修以同時具備Code與Geass的狀態復活，並與齊爾茨斯庫蒙王國展開一場決定世界命運的大戰，戰後成功救出娜娜莉。
於最後魯魯修認為娜娜莉可以獨當一面後對其告別，追上了不告而別的C.C.後，對C.C.告白並捨棄自己的名字，自稱L.L.，決定與C.C.共度永生，不再分開，兩人自此之後下落不明。
於在幕後花絮中提起，傳聞他們兩人遊走世界，四處狩獵以Geass作惡的能力者，展開回收Geass之旅。
