故事的背景是世界末日後的未來,當地的人類受到名為叫龍(叫竜(きょりゅう))的怪物蹂躪,倖存的人類組織了名為種植園的武裝都市,並將男孩和女孩訓練成操縱者(パラサイト,Parasite),配成一對並共同駕駛巨大機器人FRANXX與叫龍作戰。其中一名男孩廣在過去被視為神童,但他在一次失敗後變得無法駕駛FRANXX,這使他失去生存的欲望,直到他遇見一名叫龍和人類混血的女性操縱者02。在一次與叫龍的對戰後,廣請求了02成為自己的搭檔,而02總是稱廣為Darling(親愛的)。