有一天，獨來獨往的高中生流龍馬，突然被異形的怪物「不進化體」襲擊。就在同學被殺之時，憤怒的龍馬在神秘人早乙女的引導下乘上了巨型機器人「蓋特機器人」打敗了不進化體。及後龍馬在早乙女研究所認識了同屬蓋特小隊的神隼人和巴武藏，並得知了強敵蓋特皇帝的存在。
