SD戰國傳 武神輝羅鋼篇後大約100年後， 鐵機武者某日發生譁變， 攻擊頑馱無本陣「烈帝城」， 當時代替大將軍管治天宮的戰刃丸、鬥刃丸及紅零斗丸三兄弟， 無法抵禦， 長兄戰刃丸更被鐵機武者真星勢多所殺。紅零斗丸為報弒兄之仇， 一心希望拜師於前任將頑馱無、現已隱居的豪劍為師，但遭到拒絕。
紅零斗丸百思不得其解的時候，在山上遇到獵犬母親，因為感受到其身上殺氣，正保護著子女。他才領會到豪劍之所以拒絕，是不欲自己為著報仇殺人而習武。明白到武藝應用於保衛國家同伴之上的紅零斗丸，眼見追兵為著追殺自己，而被牽連殺害的獵犬母親，出於義憤，他力敵眾人。在敵眾我寡之時，豪劍變身巨大武者（豪劍鐵臣型態），殺退追兵。 戰事結束，豪劍終於答應收紅零斗丸為徒，並告知他，十多年前仍是將頑馱無時，由於受重傷，無法保護三大將軍以犧牲換取勝利而下台。同時，他在天界武者幫助下，變成半鐵機化，因此能以武者身份，變成巨大武者。
兩師徒向烈帝城進發，與鬥刃丸會合。中途鐵機武者軍團首領——鐵機將飛閃，率領「超機動闇將軍」突然出現，豪劍十分詫異，昔日戰友，如今竟成為叛亂分子領袖。隨行的真星勢多，再與紅零斗丸交手。激戰中途，紅零斗丸的「烈龍刀」突然崩裂，煙氣自缺口冒出，變成天界武者「烈龍頑馱無」。
烈龍被釋放後，看到超機動闇將軍，乃召喚傳說兵器、百多年前曾由武者號斗丸使用的「超機動大將軍」。一招「天斬三鳳擊」，打倒多台闇將軍，然而也由於能源消耗過大，加上由鐵機武者爆炎頑馱無指揮的「爆火隊」猛烈炮擊下，超機動大將軍亦告倒下。
巨大武者相繼倒下，戰事就由武者及鐵機延續。除了為監視烈龍而下凡的「烈風頑馱無」加入戰團，紅零斗丸更聯合「黃破猛襲隊」，使出「鳳雛斬」，突破敵陣。正當雙方僵持不下時，已轉生成天界武者的「天界武將戰刃丸」，乘著馬匹「天雷轟」來到人間，更告知鐵機武者之所以叛變，是由於掌控「心」的「鐵機心得」被調包。於是以「天幻鏡」照出附在鐵機武者的邪惡黑影。與紅零斗丸、真星勢多兩人，正在角力之際，烈龍刀、鐵斬刀產生共鳴，分別變成刕（音ㄌㄧˊ）霸一號劍及二號劍。真星勢多更在共鳴發生時昏倒。紅零斗丸就趁機換上「善」的「鐵機心得」。真星勢多等人恢復意識。
不過，鐵機將飛閃此時，卻從背後偷襲鬥刃丸，最後死於紅零斗丸及戰刃丸眼前。而附於飛閃身上的魔甲獵人「魔刃頑馱無」，看到奸計敗露，不得已現出真身，更率領魔界天鎧王來到地面，發動總攻擊。紅零斗丸及真星勢多合二為一，分別變成紅零斗丸大將軍及真星勢多大將軍，象徵武者、鐵機和解。
然而，兩名大將軍雖已合成一體，卻未達至一心同體境界，真正力量無法盡情發揮。魔刃更利用邪力，將眾人行動封閉。千鈞一髮之際，轉生中途折返的「魂武者鬥刃丸」擲槍而起，將結界戮破。此時，烈龍看到魔刃手中，正握著「刕霸三號劍」，便乘其不意，將它奪走，並交到紅零斗丸手上。刀霸三大劍齊集，紅零斗丸大將軍及真星勢多大將軍，變成終極型態「刕霸大將軍」，最後更將魔刃一刀兩斷。 大戰結束，戰刃丸、鬥刃丸回歸天界，刀霸大將軍亦變回紅零斗丸及真星勢多。兩人亦繼承兩位兄長，攜手治理天宮。