根據《五星物語》序章記述，故事講述遙遠的未來，一個由四個太陽系所組成的究加太陽星團裡亂世的戰爭中，光之神天照帝與其妻拉克西絲，以及眾多榮光的騎士們的故事。主線是圍繞不老不死的「光之神」天照帝及Fatima拉克西絲，由他們的認識、拉克西絲的失蹤及至他們所誕下超人類的女兒等等。支線則是在他們所身處的時空中究加太陽星團的戰亂及其他騎士們的故事。
故事共分為三部份：第一部故事圍繞天照帝統領究加太陽星團的經過，並以Fatima們的壽命將至問題作結；而第二部是講述寇拉斯六世反抗天照帝的替身Fatima尤龐得拉，以穿插形式出現在第一部中；第三部則是拉克西絲經歷了時空跳躍，出現在不同的時間及空間，而天照帝則搭乘戰艦「威爾」尋找她。最後《五星物語》結束於天照帝及拉克西絲婚盟上。
