自然災害導致近未來的地球滿目瘡痍。圍繞著在海底發現的神秘巨大遺跡「歐凡（オルファン）」，世界陷入混亂與爭鬥之中。企圖讓歐魯梵浮上海面、進而邁向宇宙的「回收者（リクレイマー）」，藉由使歐凡引發共鳴、喚醒世界各地出現的「板塊（プレート）」，進而產出巨型人型兵器「Grand Cher（グランチャー）」來擴充戰力。
隸屬於領導回收者的伊佐未家族的伊佐未 勇，與同僚卡南・吉摩斯（カナン・ギモス）一同執行回收板塊的任務。期間，板塊開始復甦，並誕生了Grand Cher的宿敵——「Brain Powerd（ブレンパワード）」。恰巧在場的孤兒少女宇都宮 比瑪，與Brain Powerd中的「Hime Brain（ヒメブレン）」產生心靈共鳴，這一幕令勇下定了某個決心。
時光流逝，隨著歐凡浮上海面，局勢愈發嚴峻。反覆發生的地震與海嘯使沿岸城市癱瘓，人類多數淪為難民。比瑪與Hime Brain一同成為*由聯合國主導建造的最新艦「諾維斯・諾亞（ノヴィス・ノア）」的一員，對抗回收者。
就在此時，勇駕駛著水藍色的布連力量——「Yuu Brain（ユウブレン）」現身於比瑪面前。勇在歐凡內與被廢棄的Brain Powerd產生共鳴後，選擇脫離歐凡。隨後，他被祖母直子搭乘的諾維斯・諾亞接納，追隨勇而來的卡南也加入其中。
然而，對於家族中出現背叛者感到憤怒的勇的姊姊——伊佐未 依衣子（クインシィ・イッサー），與視勇為勁敵的喬納森・格連（ジョナサン・グレーン）聯手展開無情的追擊戰，戰火不斷升級。
在各方意志交錯之下，歐凡持續浮上海面。直子、翠、依衣子三代人之間根深蒂固的恩怨，讓伊佐未家族陷入內鬥。而另一邊，思念失散兒子的諾維斯・諾亞艦長阿諾亞・馬克米克（アノーア・マコーミック），與在未曾獲得母愛下成長、心靈扭曲的喬納森母子之間，也展開糾葛。
故事便以這兩組家族的糾纏為主軸，展開交錯的人間戲劇。
