在旅途中，他結識了弟橘媛和波普瑪老伯。為了阻止邪馬台八頭龍的復活，他們希望利用傳說的三神器：草薙劍、八咫鏡和八尺瓊勾玉的力量。
在瑞穗國，由於三台魔空戰神的力量過於強大，眾人被傳送到第一月球哈亞斯上，並獲得太空船龍之搖籃。在第二月球希姆嘉上，他們救回了在十二年前急降在此的地球人和魔空戰士之一的紀奧密。在第三月球奈米哈上，武尊未能完成試煉，天野白鳥和神器八咫鏡被宿敵麥格池奪走。
回到出雲星後，武尊操縱須佐尊前往海底深處，成功摧毀了出雲星的核心。雖然須佐尊的邪惡之心被清除，但弟橘媛卻被其兄麥格池以八頭龍的邪力洗腦成為敵人。 武尊等人回到出雲村，遭到月夜見手下夏蒙的襲擊，雖解救了出雲村，但武尊的母親卻被擄走。為了阻止月夜見復活八頭龍並救出母親，武尊等人乘座龍之搖籃突入魔空要塞，終救回母親及弟橘媛，卻已無法阻止八頭龍的復活。
幸好麥格池死亡，武尊重新得到八咫鏡，而行星之魂的存放地正是出雲村。武尊集合三神器和行星之魂的力量，復活七個行星，並與須佐尊化身為光之巨人，擊敗月夜見與八頭龍，使世界再次和平。
在OVA篇中，月夜見沒有死去，集合了麥格池的靈魂、八頭龍的碎片和魔空戰神修羅尊，化為魔空要塞的碎片落入出雲村大水池中。當晚，月夜見操縱修羅尊襲擊出雲村，引出弟橘媛。在擊敗武尊並重創須佐尊後，成功擄走弟橘媛。
重傷的須佐尊吸收龍之搖籃的能量成功進化成第三階段，前去拯救弟橘媛時與八頭龍碎片變化而成的六台魔空戰神合一戰鬥，明白到只有光明能消滅邪惡而戰勝。 最後，為了阻止已附身於弟橘媛身上的月夜見復活八頭龍，武尊駕駛須佐尊決定與弟橘媛一起直飛太陽，以太陽之力徹底消滅月夜見。然而，麥格池的靈魂出現，與武尊冰釋前嫌，付託妹妹給武尊後，送走武尊及弟橘媛，與須佐尊一同抓著月夜見投身太陽同歸於盡。
