擁有尖端科學力量的「學園都市」，是一座位於東京都西部未開發地帶的學生之都。
然而在這座看似普通的城市背後，隱藏著另一面真相——它同時也是一個專門進行超能力開發的龐大研究機構。
居住在這裡的少年主角——上條當麻，右手中寄宿著被稱為「幻想殺手」的特殊能力。只要輕輕一觸，就能消除任何超能力或魔法等超常現象。除此之外，他還帶著某種「不幸體質」，經常遭遇各種倒楣事，甚至被同學戲稱為「不幸的避雷針」，倒楣到成了一種奇特的存在。
某天，他一如往常迎接著充滿不幸的日子，卻意外與一名從天而降、滿是謎團的修女相遇。這場邂逅，將使他的命運迎來劇烈的轉折——這究竟是幸運，還是不幸？
《電腦戰機 Virtual-On》是一部以電腦曆（VC）時代的地球圈為舞台所展開的宏大敘事詩。
故事背景設定於人類跨越「科技奇點」後的遙遠未來。在這個時代，人類早已突破肉體框架，進化為多層次、多樣性的存在，整個文明呈現出既繁榮又混沌的狀態。
在VC87年，人類於月球表面發現了一座名為「Moon Gate」的外星遺跡。隨著遺跡的挖掘與研究，其中的超高科技被揭露，直接促成了巨大人型戰鬥兵器「電腦戰機」的實用化。
到了VCa0年，當Moon Gate開始甦醒並失控時，人類派出電腦戰機進行鎮壓，這些機體也因此成為眾人矚目的焦點。
然而，就在此時，原本用來抑制Moon Gate的「時空因果律控制機構——七巧板」卻掙脫了束縛，逃逸至名為「電次元」的彼方。人們為了奪回七巧板展開激烈爭奪戰，甚至發展出一種名為「聖樂‧七巧板」的新產業。雖然這產業繁華似永無止境的慶典，但地球圈卻在不知不覺中邁入了衰退，逐步走向無可避免的崩壞。
另一方面，漂流的七巧板最終來到一個嶄新的世界，並對那裡的一個現象產生濃厚的興趣。這個地方就是「學園都市」——學生們努力鍛鍊能力的同時，暗地裡各種陰謀不斷滋生，而其核心更是籠罩著層層謎團。隨著七巧板的注視，兩個世界的命運逐漸交織，全新的故事由此展開。
VR - Virtuaroid / 電腦戰機
在學園都市中所使用的電腦戰機，為方便分類，統一被歸納為「G55型」。這些機體是七巧板漂流至此後進行干預的成果，透過將電腦曆世界線的原始模組（VC模組）轉換後，才誕生的穩定機種。
G55系列的機體技術水準，以電腦曆世界中的「第二世代型」為核心。它們所搭載的控制作業系統為 MSBS ver.55。雖然主要用途是作為學園都市內遊戲《電腦戰機 Virtual-On》的營運機體，但實際上它們的活動範圍並不侷限於遊戲世界，甚至能夠直接在現實空間中運作。
