為了尋找能帶來不老長壽的秘藥「生命之源」（命のもと），並將其用於實現世界和平，紋者博士成功開發出了「時間隧道」（タイムトンネル）。然而，企圖為了自身私利奪取「生命之源」的惡黨三人組「アクダマトリオ」，也意外發現了另一個時間隧道的入口，成功進入了時間隧道，試圖搶奪秘藥。
面對這場危機，紋者博士的孫女小櫻（さくらちゃん）與博士的助手鐵醬（鉄ちゃん）挺身而出，變身為滿懷善意的正義戰士「ゼンダマン」，展開一場阻止惡黨野心、守護歷史與和平的時空之戰。
本作即是描寫小櫻與鐵醬化身為ゼンダマン，對抗アクダマトリオ陰謀的冒險故事。
