性悪教師・羽柴の策略によって、8人の高校生たちは特殊金属で造られた巨大ロボ「ガクセイバー」のパイロットにされてしまう。理不尽な展開に戸惑いながらも、単位取得を条件に掲げられた彼らは、否応なく戦いに巻き込まれていく。 彼らの敵は、地球侵略を企むワーキュリーら異星の侵略者たち。高校生活と戦闘任務という二重生活を送りながら、8人は少しずつ絆を深め、ガクセイバーと共に戦い抜いていくことになる。