原作の内容を忠実にアニメ化することが設定上極めて困難であったため、本作では特撮版とは大きく異なるアレンジが加えられている。アニメ版では、新たにデザインされたレインボーマンや、巨大ロボット「レインボーセブン」の登場、さらには敵組織「死ね死ね団」の首領が宇宙人という、全く新しい設定が導入された。 また、特撮版では孤独な戦いを続けていたヤマトタケシ＝レインボーマンが、今作では仲間たちとともに力を合わせて戦う構成となり、全体的に明るく痛快なヒーロー活劇として描かれている。
