舞台は現代の東京・武蔵野。貧しくも力強く日々を生きる島原三姉妹のもとに、10年以上行方不明だった兄・勝流から一通の手紙が届く。手紙を届けに来た少年に導かれ、三姉妹は遠く南の島・バロウ王国へと向かうことになる。
現地で知らされたのは、兄・勝流が島の姫と結婚していたこと、そして2か月前に彼が亡くなり、その直後に姫も命を落としたという衝撃の事実だった。島の人々は勝流の血を引く三姉妹こそが新たな王族であると認め、彼女たちに“神”と呼ばれる存在――巨大な神獣「ネオランガ」を託す。
突如として“王”と“神”を与えられた三姉妹と、ネオランガとの新たな物語が、ここから始まる。