1926年，法國巴黎。當時，這座城市在經濟和文化上是世界頂尖的，但城中卻頻繁發生由神秘怪人引發的事件。為了對抗這些事件，法國政府成立了一個旨在靈魂層面保護城市的組織，即「巴黎華撃團」。團隊的隊長位置聚焦在一位東方人身上，他就是兩次救過日本帝都的「帝國華撃團・花組」隊長，大神一郎。
在與黑鬼會的戰鬥結束後晉升為中尉的大神，以海軍留學生的身份前往法國。但他剛剛適應異國風土，就迅速得知自己被派遣的真正目的。以劇場「Theâtre Chanoir」為基地，大神和巴黎華撃團・花組的成員們勇敢地對抗怪人。在這個花之都的歐洲舞台上，一場新的戰鬥拉開了序幕。