- Work福音戰士新劇場版:序/シン・エヴァンゲリオン劇場版:序
- Pilot碇シンジ
登場於《序》。除了細節設計和顏色有變更外,其餘與《新世紀福音戰士》中的設定相同。
寄宿著碇唯靈魂的EVA。塗裝為主色系為紫色,副色系為螢光綠,強調整部機體的異型感,駕駛者是第三適任者碇真嗣。
外型與其他的EVA可說是天壤之別,頭盔如同獨角獸般的銳角設計,以及具有人形但更偏於獸性般的銳利雙眼設計,嘴的部分在暴走狀態下還能開闔,具有利牙能啃食對方,而最明顯的不同處在於平坦的片狀胸部裝甲版,以及有稜有角的外表。據說初號機稜稜角角的外表,是為了在暴走時帶給敵人身體巨大損傷所配置的,擁有攻擊型裝甲的設計概念。
標準武裝為裝置在左肩拘束器上的高振動粒子刀,而初號機有專屬的式樣,與普通的粒子刀相比,更具殺傷性及恐怖的破壞力。
初號機會在危險逼近時暴走,這點也和原作一致。但由於對應雷利爾的使徒未登場,劇中的暴走次數僅為兩次。新武裝包括加特林砲,但在對抗第五使徒時未能造成有效打擊。在第六使徒戰鬥的監視畫面中,可以看到其固有波形模式為「Blue**A'」。在對抗第十使徒時,初號機在真嗣「即使世界毀滅也要救綾波」的強烈意志下,進入了疑似神化第1覺醒形態。在這種形態下,由真嗣控制,釋放出潛藏的能力。此時初號機的拘束具從螢光綠變為紅色,頭頂出現了天使光環。它能夠用A.T.力場形成的左臂攻擊,並從雙眼發射光束,展現出如使徒般的攻擊能力。最終從使徒的核心中取出零號機的核心,連同綾波一起救出。插入栓深度超過180,讓律子稱其「超越了人類的界限」。
隨後,初號機與取得零號機核心的巨大人形體(由形象崩壞的使徒體液聚集而成)融合,進入與第二次衝擊時出現的四體光之巨人相似的三眼光之巨人「疑似神化第2形態」,並幾乎引發第三次衝擊。然而,從月面降下的Mark.06投出的卡修斯之槍在初期階段成功阻止了衝擊,並將其限制為「近第三次衝擊」。之後,初號機帶著真嗣和綾波的插入栓停止活動並被凍結。
後來,初號機被封入棺材並在大氣層外以核心化狀態封印。反NERV組織WILLE展開奪取作戰。即使經過14年,初號機仍未完全解除覺醒狀態,作戰中當明日香呼喊真嗣時,初號機回應並向Mark.04B發射光束,支援改二號機。接收後,初號機被用作WILLE的空中戰艦AAA Wunder的主機。此時真嗣與初號機的深層同步率為0.00%,律子表示即使真嗣登艙也無法啟動。因擔心作戰中再度覺醒,WILLE的上層決定給真嗣戴上DSS項圈(感應EVA覺醒時會殺死駕駛員以解除覺醒狀態的項圈),並作為檢體對待。
在南極戰鬥中,Wunder被嚴重損毀,初號機被源堂與第十三號機回收。此時的初號機已變為紅色核心化狀態,四肢被切斷。當真嗣希望登艙時,發現實際上的同步率雖接近0,但其值為無限大。在真嗣操縱下與源堂的第十三號機對峙,然而未能戰勝。在雙方精神對話後,源堂接受了真嗣「創造無需EVA的世界」的意志,並與碇唯一同用WILLE之槍(Gaius之槍)貫穿身體而消失。