距今約一億七千萬年前，邪惡的女王「魔女潘多拉」試圖滅絕人類、征服世界，但她與手下最終被守護神封印在遙遠偏僻的星球「涅墨西斯」上的宇宙封印甕中，從此沉寂。
然而，時隔億年，現代的宇宙太空梭在探索涅墨西斯時，因組員的好奇心意外打開了封印甕的蓋子，讓潘多拉與其部下得以脫逃，重返宇宙。
與此同時，守護人類世界的善良白魔導士「巴札」察覺到潘多拉的復活。他立即前往地底神殿，喚醒五位長眠已久的古代五族戰士，並賦予他們新的使命——化身為保護地球的「恐龍戰隊獸連者」。
獸連者與五隻擁有神聖力量的恐龍守護獸一同並肩作戰，挺身對抗潘多拉及其手下的邪惡勢力，展開一場橫跨時空的正邪決戰，誓言守護地球與人類的未來。
