玩具店老闆的兒子——阿鋼(ガンちゃん),某日發現父親曾經製作卻中途放棄的大型犬型機器人。他與女友愛醬(アイちゃん)兩人悄悄地將這隻機器狗完成。然而,阿鋼擔心父親若得知此事,只會將機器狗當作賺錢的工具,於是決定讓這台機器狗成為正義的象徵,並立志成為守護正義的英雄——「ヤッターマン」。
與此同時,以詐騙生意發家致富的惡黨集團「多龍寶一味(ドロンボー一味)」,某天接到一名自稱「骷髏神」(ドクロベー)的神祕人物的聯絡。對方聲稱:記載著巨額黃金塊所在位置的「骷髏石」(ドクロストーン)已被分成四塊,散落在地球各地,其中一塊他本人保管著。如果多龍寶能找到其餘三塊,他願意與他們平分黃金。
為了金塊,多龍寶一行人開始追尋骷髏石。得知這一計畫的阿鋼與愛醬,則駕駛著機器狗「ヤッターワン」,與多龍寶展開正義與邪惡的對決。