位於薩摩亞群島東南方兩千公里外，有一座在地圖上被抹去名字的神秘孤島——「奧斯特拉爾島」（オウストラル島）。 為了追尋被隱藏的真相，田神悠宇（たがみ ゆう） 承襲亡父的遺志，踏上了一場冒險之旅。
在父親的好友威布博士（ドクター・ウェィブ）、其妹妹多莉絲（ドリス），以及自稱「船長」（キャプテン）的男子協助下，悠宇駕船前往奧斯特拉爾島。 然而，他們的行動被龐大的跨國企業蓋爾集團（GAIL／ガイル） 以及由莉迪・林克斯（レディ・リンクス） 所率領的黑幫組織 美洲獅連線（クーガー・コネクション） 所鎖定。
好不容易抵達島上的悠宇等人，卻突然遭到謎樣怪物的襲擊。正當絕望之際，一名如藍色巨人般的機械生命體現身，擊毀了怪物並救下悠宇。 面對這個超越人類知識的存在，悠宇心中卻湧起一股莫名的溫暖與懷念。
在被島上居民尊為「神之使者」的藍色巨人——GROG（ゴーグ） 的引導下，悠宇一行人躲避著蓋爾戰鬥部隊的追擊，最終抵達了隱藏於地底深處的異星文明遺跡，並與沉睡三萬年的外星人展開了命運般的邂逅。
