在地球與宇宙之間的衝突於殖民後195年聖誕前夕結束後，地球與殖民地聯合在新成立的地球圈統一國旗下，邁向了全面和平的道路。到了殖民後196年的聖誕前夕，除了五飛之外，希洛等四位鋼彈駕駛員決定將他們的鋼彈送往太陽銷毀。然而，就在全球都在慶祝聖誕的同時，隸屬於地球圈統一國家的維和組織「預防者」卻在L3宙域發現了戰爭的苗頭：用於製造新型機動戰士的裝甲材料——新鈦合金。
巴頓財團的領袖兼流星作戰原計劃的主謀德基姆·巴頓，利用前OZ總帥特列斯之女瑪莉梅亞作為傀儡領袖，成立了軍隊，並以殖民地L3 X-18999為基地，同時綁架了擔任地球外交官、前往X-18999訪問的莉莉娜作為人質。德基姆試圖利用新型機動戰士「沙貝特」及X-18999殖民地實施真正的流星作戰——透過讓殖民地墜落來使地球陷入混亂，隨後再使用機動戰士進行武力鎮壓。鋼彈駕駛員們被迫分頭行動：卡特爾駕駛太空梭前往回收即將被送入太陽的鋼彈，而希洛和迪歐則潛入殖民地以化解這場危機。然而，攔在他們面前的，卻是已加入瑪莉梅亞軍的五飛和特洛瓦...
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