外貌酷似零號機，出現在《福音戰士新劇場版：Q》中的機體。由綾波零 (暫稱) 駕駛。 在第13號機神化的同時也以Adams的容器覺醒(被美里稱為Wunder的原本之主)，覺醒後不受綾波控制，在無頭部的狀態下，發出光束攻擊AAA Wunder，並重新長出和原本完全不一樣的頭部，其後解除頭部的光環，機體色調也隨之變暗，和AAA Wunder接觸，企圖侵占初號機，與進入獸化狀態的改2號機交戰，被改2號機咬掉頭部，此時系統阻斷，綾波便依照自我意志射出插入栓，明日香才把核心破壞，但由於Mark.09全部都是核心組成，便毫無損壞的回復，在此情況下明日香射出插入栓令改2號機自爆，Mark.09終被摧毀。
EVANGELION Mark.09
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