在與「穆戈·索爾巴多斯帝國（ムゲ・ゾルバドス帝国）」及「迪拉德（ディラド）」的戰爭結束200年後，時間來到22世紀的地球。
人類成功復興，再次恢復文明社會的生活。然而，日本卻因經濟破產而陷入衰退，並因少子化影響，將15歲視為法定成人。儘管有限的都市地區依然享受著和平，且並未發生世界大戰，但地區性紛爭卻從未間斷。
在這樣的時代，各地的戰場上開始流傳著一個傳聞——一台神秘的巨大超級機器人「斷空我（ダンクーガ）」會突然出現，站在弱勢的一方，攻擊強者，使戰局回歸均衡，然後便悄然離去。
某日，四名彼此互不相識的年輕男女，幾乎是在接近綁架的狀態下，被帶往一座神秘的巨大基地「龍之巢（ドラゴンズハイブ）」。
當他們在基地內醒來時，發現自己已在無意識間透過「睡眠學習」，掌握了操縱巨大機器人「斷空我NOVA（ダンクーガノヴァ）」及其構成的四台「可變獸機（ヴァリアブル・ビースト・マシン）」的方法。
被選為駕駛員的四人，雖然內心充滿困惑，但最終還是踏上戰場，開始了他們的戰鬥之旅。
