在赫爾意圖征服世界的野心被擊潰後，卻有股潛伏於地底的新勢力趁虛而起，正打著作收漁翁之利算盤的『海底（ミケーネ）帝國』，開始以『戰鬥獸』大肆揮軍攻向地面。仍還浸溺於和平之中的光子力研究所，即而遭遇到了另場空前未有的新危機，連マジンガーZ也不敵如此凜厲的猛攻。就在這一個萬念俱灰的存亡旦夕之際，隱遁未死的兜剣造赫然現身一聲號令！劍鐵也乘坐著金剛大魔神劃過夕陽從天而降，輕而易舉地將來犯敵軍通通一掃而空。從此便接替甲児扛起保衛世界的重任，展開了另場正邪之間波瀾壯闊的死鬥。