在石油枯竭，汽車飛機逐漸荒廢的未來世界，電氣鐵道為主要輸送來源的首都，號稱海上未來幹道都市的努貝爾東京市卻在背後隱藏一股邪惡黑暗的犯罪陰影，給這城市人們帶來莫大威脅。
這時，掌握電氣鐵道為動力，號稱世界第一鐵道王的大財團「旋風寺集團」，一位帥氣多金又有英雄氣概的少年總裁旋風寺舞人，他繼承父母因為突發車禍事故身亡而擔下重責大任，結合父親生前研發的超級AI系統，在搭配集團下的各種新幹線列車（包括主要列車勇者機關車）成立了一組立志殲滅罪惡，伸張正義，捍衛幸福未來的勇者特急隊，在努貝爾東京市陷入罪惡深淵的時候，為了捍衛人類的未來與幸福，旋風寺舞人率領的勇者特急隊即將準時抵達！